مقایسه الگوی pcr-rflp با توالی یابی مستقیم ناحیه its نمدارهای هیرکانی
نویسندگان
چکیده
یکی از نشانگرهایی که امروزه به عنوان dna بارکد برای گونه های گیاهی پیشنهاد می شود، تعیین توالی ناحیه هسته ای its است. از آنجا که توالی یابی روشی پَر هزینه و نیازمند زمان طولانی است، این مطالعه با به کارگیری روش pcr-rflp قصد دارد تا ضمن مطالعه الگوی چند شکلی ناحیه its نمدارهای هیرکانی، نتایج این دو روش (توالی یابی و pcr-rflp) را با یکدیگر مقایسه نماید. به این منظور با استفاده از هشت آنزیم برشی، الگوی الکتروفورزی 9 گونه نمدار جمع آوری شده از جنگل های هیرکانی شمال ایران بررسی شد. نتایج نشان داد که علاوه بر آنزیم ecori که فاقد جایگاه برش در گیاهان گل دار است، آنزیم bsrbi نیز در تمام توالی های نمدار مطالعه شده، بدون جایگاه برش است. هر دو روش گونه های مورد بررسی را در 9 گروه مجزا قرار داد و تنها تفاوت در گروه بندی گونه tilia begonifolia steven است که یکی از پایه های آن در روش rflp با گونه t. hyrcana tabari and colagar و در روش توالی یابی مستقیم با گونه t. rubra rupr. در گروهی مجزا قرار گرفته است. همچنین، میزان همسویی نسبتاً بالای این دو روش با استفاده از آزمون منتل نیز تأیید شد (57/0r=). تحلیل pcoa نیز گویای تمایز گونه های t. dasystyla، t. hyrcana و t. rubra و با منشأ هیرکانی از یکدیگر است و تنها گونه t. begonifoila را نتوانسته است از این گونه ها جدا نماید. بنابراین، با توجه به نیاز به صرف زمان و هزینه کمتر برای روش pcr-rflp ناحیه its و نیز همسویی نسبتاً بالای نتایج آن با روش توالی یابی مستقیم، این روش به عنوان روشی مناسب، ساده و کم هزینه برای تبارشناسی گونه های گیاهی پیشنهاد می شود.
منابع مشابه
مقایسه الگوی PCR-RFLP با توالی‌یابی مستقیم ناحیه ITS نمدارهای هیرکانی
یکی از نشانگرهایی که امروزه به عنوان DNA بارکد برای گونه‌های گیاهی پیشنهاد می‌شود، تعیین توالی ناحیه هسته‌ای ITS است. از آنجا که توالی‌یابی روشی پَر هزینه و نیازمند زمان طولانی است، این مطالعه با به کارگیری روش PCR-RFLP قصد دارد تا ضمن مطالعه الگوی چند شکلی ناحیه ITS نمدارهای هیرکانی، نتایج این دو روش (توالی‌یابی و PCR-RFLP) را با یکدیگر مقایسه نماید. به این منظور با استفاده از هشت آنزیم برشی، ا...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملمطالعه گونه های یونجه (medicago l.) براساس توالی یابی dna ریبوزومی هسته ناحیه its
بررسی روابط تکاملی و فیلوژنی در گیاهان، از طریق صفات مورفولوژیکی همواره متداول بوده است. گیاهان براساس ویژگی های موفولوژیک متمایزکننده شناسایی می شوند (du1 et al., 2006). در بعضی موارد شناسایی گونه های گیاهی براساس صفات موفولوژیک مشکل و دارای محدودیت است. در مواردی نشانگرها و صفات مورفولوژیک به علت تاثیرپذیری از محیط کارایی کمی در شناسایی و رده بندی گونه ها دارند (shen et al., 1998). در سال ها...
15 صفحه اولمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
تاکسونومی و بیوسیستماتیکجلد ۵، شماره ۱۷، صفحات ۷۳-۸۲
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023